Tem por objetivo controlar os produtos comprados destinados ao estoque, bem como as saídas destes produtos na sua utilização, possui a integração com o modulo compras, onde com o lançamento da nota fiscal de compra alimenta-se o modulo estoque. Através deste modulo é possível controlar a ficha de cada produto, ou seja, entrada e saída e custo médio, ter posições diárias de estoque e ainda possibilita ver os indicadores de aplicações.

Também é pelo Controle de Estoque que são lançadas as aplicações de insumos na lavoura, para que possam depois ser utilizados nos relatórios de resultados de custo por safra, atividade, lavoura, talhão e até mesmo por variedade plantada.